小康文章阅读笔记

小康文章阅读笔记

分子模拟

自用Docker一览

如下是我自用的一些Docker 1. gromacs-GPU Docker 自写gromacs Docker,CUDA版本12.1,gromacs版本 gromacs-2024.5 可从此下载:Dockerfile # Use an official Ubuntu base image FROM n
31
0
0
2025-05-31

gaussian安装

安装 下列内容需要在同一个目录下,比如~/install目录下 解压缩: tar -Jxvf G16-C01-AVX_Downloadlyr.tbJ gview解压缩: tar -vxf gv6.tar.bz2 写入环境变量: # gaussian export g16root=~/instal
50
0
0
2025-03-27

GROMACS蛋白配体复合物模拟

gromacs小分子的配体的电荷问题一直时gromacs模拟蛋白-配体复合物中的难点与重点~网上有许多相关方面的教程,但是都没有成为系统,应李继存老师之邀,把最近摸索的方法过程总结出来,分享给大家~感谢网络上的朋友对我的帮助~ 一、配体文件构建 1. 高斯输入文件建立: antechamber -i
108
0
0
2025-03-27